Sin perjuicio del rol que les compete a las autoridades regionales en su organización, la coordinación de las acciones tendientes a materializar los objetivos acordados al interior de los mismos corresponde a las respectivas Cancillerías. En Chile, esta tarea está radicada, específicamente, en la Dirección Nacional de Fronteras y Límites del Estado.

Actualmente, las regiones chilenas participan en Comités de Frontera e Integración con sus pares de los tres países vecinos; Argentina, Perú y Bolivia.
A solicitud de las Regiones chilenas y Provincias Argentinas y por disposición de los respectivos Gobiernos, los Comités de Frontera con este país, han pasado a denominarse "Comités de Integración". Con Perú y Bolivia se ha comenzado a trabajar en similar iniciativa.

La tarea de compatibilizar los sistemas operativos y reglamentaciones de cada país para el cumplimiento de las funciones de los servicios de control fronterizo es un desafío que requiere de coordinación, intercambio constante de información, especial atención a las particulares características que presenta cada paso fronterizo y permanente atención a los cambios o circunstancias sobrevinientes.
Su origen lo encontramos en el Acta de Entendimiento de Buenos Aires, firmada por las Repúblicas de Chile y Argentina el 16 de noviembre de 1984, la cual, con el objeto de avanzar en el tratamiento bilateral de los proyectos de integración chileno-argentinos, hizo referencia a los Comités de Frontera, acordándose entonces la constitución gradual de tales foros, los que debían integrarse por los organismos de ambos países que intervienen en los pasos de frontera.

De esta manera se fueron creando los diversos Comités de Frontera que actualmente funcionan, ya sea mediante intercambio de notas verbales, Memorándum de Entendimiento o acuerdos adoptados en el seno de la Comisión Binacional Argentino-Chilena de Cooperación Económica e Integración Física, órgano originado en el Tratado de Paz y Amistad de 1984.
Los ahora Comités de Integración que funcionan entre Chile y Argentina mantienen reuniones periódicas en las que se van abordando temas específicos relacionados con la facilitación del tránsito transfronterizo, aspectos aduaneros, migratorios, sanitarios y otros. También han constituido foros donde se recogen inquietudes regionales relacionadas con el desarrollo de las funciones de control fronterizo y la facilitación del tránsito terrestre binacional.

El 8 de agosto de 1997 se celebró en Santiago el "Acuerdo entre la República de Chile y la República Argentina para Establecer un Reglamento para los Comités de Frontera", en el marco de la Declaración Presidencial Conjunta de los Mandatarios de ambos países, y en virtud del cual se reconoce el funcionamiento de siete Comités de Frontera, más un Sub-Comité. Posteriormente, el año 2005, el Subcomité de Aysén – Chubut, pasó a formar parte del Comité de Frontera Integración Austral.
El mencionado reglamento se aplicará asimismo, a los futuros Comités de Frontera que los Gobiernos de Chile y Argentina decidan constituir mediante canje de notas diplomáticas.

Se estableció con fecha 10 de junio de 1999. Comprende el Departamento peruano de Tacna y las Provincias chilenas de Arica y Parinacota.

Dentro de sus objetivos están comprendidos los siguientes:

• Participar activamente en la solución de los problemas operativos del tránsito y tráfico de personas, vehículos y bienes;
• Promover el desarrollo de las zonas de frontera, así como la cooperación e integración regional;
• Considerar e impulsar proyectos conducentes al desarrollo y mejor entendimiento entre las poblaciones fronterizas.
  

Creado en marzo de 1997, comprende las Regiones chilenas I de Tarapacá y II de Antofagasta y los Departamentos de La Paz, Oruro y Potosí de Bolivia. Comprende asimismo, los pasos fronterizos habilitados entre ambos países y su correspondiente área geográfica.

Según lo señala el Reglamento adoptado en 1998, constituye el foro bilateral para el tratamiento de los temas de interés común del área fronteriza y tiene por objeto promover la facilitación y coordinación fronteriza mediante la formulación de recomendaciones para la adopción de medidas que agilicen el movimiento de personas, vehículos y mercaderías a través de la frontera común, así como proyectos de desarrollo fronterizo. Este Comité está integrado por las autoridades e instituciones públicas de Asuntos Exteriores y de Fronteras y representantes de los servicios públicos de control fronterizo o vinculados a la actividad fronteriza, con asistencia de otras entidades públicas y del sector privado relacionados fundamentalmente a la actividad turística y comercial .