Además, asesora al Ministerio de Relaciones Exteriores (MINREL) en el cumplimiento de las obligaciones asumidas por Chile en el Sistema del Tratado Antártico, coordinándolas con las del Programa Antártico Nacional.

Junto al MINREL, le corresponde autorizar las actividades científicas que otras instituciones nacionales deseen realizar en la Antártica.

Los funcionarios que trabajan en el INACH se organizan actualmente en seis Departamentos para realizar su misión:

Departamento Científico
Departamento de Difusión
Departamento Técnico-Logístico
Departamento de Finanzas
Departamento Administrativo
Centro de Informática y Telecomunicaciones

El INACH se ubica en Plaza Muñoz Gamero 1055, en pleno centro de la ciudad de Punta Arenas, desde donde abre sus puertas para recibir a los investigadores y al público general.